mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGAACACAGCTGGTGGTATCTCAGT AGGGAGCCACTCTGCGTTCACT GTGCTCGGAGAACAGGGAGCCACTCTGCGTTCACTCGGTAGGTAAAGAAGCGGGTGAACACAGCTGGTGGTATCTCAGTTTTCTGAGGGC 2 3 3' arm Nasonia_vitripennis mirbase mir-317 3e-38 ngi-mir-317 7e-42 -45 ((.((((((((((.(((((((((((((.(((((((((.(.........).))))))))).)))..)))))).)))).)))))))))).)) (-45.00)