mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTGAATAAGACGACTGGTCAA GAGCACTCGTTTTATTCAAAA TATTAAGTGTTACTCCCTCCGTCCCAGTTTTTAATTCATTTGACTTTTTCAATCCTAACTTTGAGCACTCGTTTTATTCAAAACATTTGTAAAAAACAAAAAAATCATTGTGATTTTGTTTATTTCAAATGTACTTTACATATGTCTTTTTTTCCCCATTTTTTCATGATTTTTTTGAATAAGACGACTGGTCAAAGTCGAGGTTGAAAAAGTCAAACTAATTATAATTTGAAGCGGAGGGAGTATAATAAATG GCACGAGGTGGTTAGGTGACTGCATTTGCGTGTACCTTGGCAAAGCACAGGAAATCATCAGTTGTCGAAGCCAAGGATGTGTTGCTGCACTTAGAAAAAAATTGGAATTTATCTATTCCTGGTTTCTCACGGGGGGATAAGAATCCTCAAAGAAATTCTGTAAGATCACATCACTTTGCAATTACTATTATTCTTCATTAACCTATCTTGCACAGAGGCATACTTTTCTCTTTAGCTCCTTTGTCTCTGCATTTGTGCTATACAAGTGTACAATATAGGTGTGTTTCGTTCAGCTTTTTAAACCTGCTTCGGCTTTGAAAGGCAGAGGCTGAACCAGAGGTGTTTGGCTTTGCTAGAACTACTTTTTAAAAACAGCTTTTTATACAAATTTGAAAGCAGCTTGGAGAGCCCTGCCTTTGCTGCTTATCCAAGTTCGATATATTAATAAAGAGACACGTCAAATAGAAATTAAAATAGGATTAAAAATTATTAAGTGTTACTCCCTCCGTCCCAGTTTTTAATTCATTTGACTTTTTCAATCCTAACTTTGAGCACTCGTTTTATTCAAAACATTTGTAAAAAACAAAAAAATCATTGTGATTTTGTTTATTTCAAATGTACTTTACATATGTCTTTTTTTCCCCATTTTTTCATGATTTTTTTGAATAAGACGACTGGTCAAAGTCGAGGTTGAAAAAGTCAAACTAATTATAATTTGAAGCGGAGGGAGTATAATAAATGGAATGAAATATATTTTTAATAAAACAATATTAAAAGTGGAATTGAAAATTGATTCATTAATTCAATATATTAATGAAGATATACGGAAAATAGAAAATAAAATGGGACTTAAAACAATTAAGTGTTATAATAAATGAAATAAAAA 2 0 3' arm Zea_mays mirnest MIR806 0.00006 osa-MIR818e 0.00001 -77.5 ......((..((((((((((((..(((.((.(((((..((((((((((((((.(((.(((((((.((.(((((((((((((((...((((.(((((..((((((.((((((((....((.((((...)))).)).))))).)))...))))))......))))).))))...))))))))))))))).)).)))))))..)))))))))))))))))..))))).)).)))..))))))))))))..))..... (-77.5)