mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TATCACAGCCAGCTTTGATGAGC TCATCATCTGGTTGTGAAATGTG GGTGTAGGCTTTCGCTCATCATCTGGTTGTGAAATGTGAATTTATATCATATCACAGCCAGCTTTGATGAGCGCAAGAGTGCACT 1 4 3' arm Tribolium_castaneum mirbase mir-2 6e-30 tca-mir-2b 4e-43 -43.5 ((((((..(((.(((((((((.((((((((((..(((((.......)))))))))))))))...))))))))).)))..)))))) (-43.50)