mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CTTTGGTAATTTAGCGTTTGT AAAGCTAGATTACCAAAGCA TTGACGACCGTAAGTTTCTTTGTTTTTGGTTCCAACAGGTGGGGGCCGATTTTGTTACTTTGGTAATTTAGCGTTTGTGATTTTATTTGAGTCATAAAGCTAGATTACCAAAGCAATGCGGTTGGCATTGCGTCGTGGAGATTGGAGTTGGAATAAGAAGACGTTCATT 0 1 5' arm Tribolium_castaneum mirbase mir-9 1e-26 tca-mir-9b 6e-93 -60 .....((.(((...((((((...((((..((((((((.(((.((((((((..((((.(((((((((((((((.((((((((((.....))))))))))))))))))))))))).))))..)))))).)).)).).))....))))))..)))).))))))))).))... (-60.00)