mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure AGTGGGAGCGTGGGGTAAGAA CTTCCCTATGCCTCCCATTCC CAGAGGAGGAGGAGAGGAAGATTGAAGCGAGGAAGTTTTGGGAGTGGGAGCGTGGGGTAAGAAGTGAAGAAAACGTATAATTTTTCTTTTCTTTTTCAATTGAGAAAGAAAATTACAAATTCAATTTCTTCCCTATGCCTCCCATTCCTATGATTTCCTGCAGTTCCTTCCTCTCTTTATCATCTCT CCACGCGTCCGTTTTTTTTAATTATTAATCACTTGCTTTTGCAAGCTGCAGCTTTGCTTACTTTTACCGGAGGGCATTTACAACACTTTTACTTGCATAGTTGTGTTGTGAATCTAGAAACAGAGGAGGAGGAGAGGAAGATTGAAGCGAGGAAGTTTTGGGAGTGGGAGCGTGGGGTAAGAAGTGAAGAAAACGTATAATTTTTCTTTTCTTTTTCAATTGAGAAAGAAAATTACAAATTCAATTTCTTCCCTATGCCTCCCATTCCTATGATTTCCTGCAGTTCCTTCCTCTCTTTATCATCTCTTCGTCGACTTTAGGAACCGTGCTTGATTTCTTCAGTTCAATTTCTGGTAAGGTATCTCTTCTTTCTATTTATTTTGTGGGGGATGACGTCATCATTTTTCCTTCTATCGTTTTCATATCAAGCTTCTTCTTCTTTTTTTATTAATTAATCAATCTTGTTTGTTACAATTTGGCTATGGATCCCCTTCGTGGCTGGGTTTTAACATCAGTCATGGCGGGGAGATGTAAAAGACAGGGTTCGATGAGATATCCTTGATGGCGCGTCGTTTATAATGTTTTATGCTAACGACATGACATTTCATTTATAAATATGCAGACGACATGACATCTTAATGTTTCATATTCCTCCTCCCTTCATCTGTGATTTTCAGTGATAGATTCTGAAAGGGTTTTTATAAATTAACAGTTTACTTCTTGGGCACCTTATATGGTAAAACAGTTTGTAAGGTTTTTGTACCCGGGTTTGGGTTTGCCAAATCTAATTGAAAAACTTCCTAACATTTGGGATTGTCAGAAACAAAAACAA 0 2 5' arm Citrus_reticulata mirnest 100 csi-MIR482a 1e-35 -73.9 .(((.((.((((((((((((...(((((.((((((((.(((((((((((((((((((.(((((((...(((...(((.........(((((((((((....))))))))))).)))...))).)))))))))))))).)))))))))))).))))))))))..))))))))))))))).)).))).. (-73.9)