mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCTTTGGTGATCTAGCCGTGTG CGCGTCTAAGTCGCCAAGATT TGATTTTGCTAACGCGTTATCACTTCTTTGGTGATCTAGCCGTGTGAATTATTTTTGAAATCACGCGTCTAAGTCGCCAAGATTTGATGATGTGTCTAACAACTGGA 3 1 5' arm Tribolium_castaneum mirbase 100 tca-mir-9c 4e-56 -38.9 .....(((.(((((((((((((..((((.(((((..(((.(((((((.((.......)).))))))).)))..)))))))))..))))))))))).)).)))..... (-38.90)