mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGGGATTCTGACTGTGACCTGT ATCACAGGCAGAGTTCTAGC CAAACGCTTACATTGTAAATGCATTCTGGGATTCTGACTGTGACCTGTGTGTGTCTGATTCACATCACAGGCAGAGTTCTAGCTATGCGTTTACAGCTTGCTTCTC 1 2 5' arm Tribolium_castaneum mirbase mir-11 5e-34 tca-mir-11 2e-55 -42 .....((.....((((((((((((.(((((((((((.((((((..((((.((.....)).)))))))))).)))))))))))..))))))))))))...))..... (-42.00)