mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TATCACAGCCACTTTGATGAGC CGTCAATTTGGTTGTGAACTC GAGATGCCCAAGTCGTCAATTTGGTTGTGAACTCTTAATTTAAACGATATCACAGCCACTTTGATGAGCTTGGTTGTCTT 5 0 3' arm Tribolium_castaneum mirbase mir-2 6e-30 tca-mir-13a 4e-40 -33.7 (((((..((((((((((((..(((((((((..((...........))..)))))))))..))))))).)))))..))))) (-33.70)