mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure AGCTGGTTGAATCCGGGTCA GTCCCCTTCAACCAGCTGT GCAATGTGCAGCTTTAGCTGGTTGAATCCGGGTCAAATTGTAAATGCTATTTGGTCCCCTTCAACCAGCTGTGGTTGACATTGC 4 1 5' arm Tribolium_castaneum mirbase mir-133 4e-40 tca-mir-133 2e-42 -44.2 (((((((.(((((.((((((((((((...((..(((((.((....)).)))))..))..)))))))))))).)))))))))))) (-44.20)