mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TACTGGCCTGTTAAGTCCCAAGT TTGGGCCTTATAGGTTCAGTTGA GCAAACTGGTCGTAATGGTTTGGGCCTTATAGGTTCAGTTGATCATTTTTAAAGCTACTGGCCTGTTAAGTCCCAAGTTATTACATTGCCGGAAGCT 3 2 3' arm Tribolium_castaneum mirbase 100 tca-mir-193 3e-50 -33.33 ((...(((((.(((((..((((((.(((((((((.((((.................))))))))).)))).))))))..)))))...)))))..)). (-33.33)