mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure GATGGGTGAGGGTTTGGTGCATG TGACTAGATCCACACTCATCCA GGTAGTTATCCTAAAGTTTTTGATGGGTGAGGGTTTGGTGCATGTTTTATTTTAATCATGACTAGATCCACACTCATCCAAAAATTTGGTGT 1 1 5' arm Tribolium_castaneum mirbase mir-279 5e-43 tca-mir-279b 3e-47 -31.4 ..........(((((.((((.((((((((.(((((((((.((((.((......)).))))))))))))).)))))))).)))).)))))... (-31.40)