mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure GCCAGTGTTCAGTCTATTGTTTCA ACTAGATCGAACACTCGCTT CGGTGGAGCTCTCGGTGTAAGCCAGTGTTCAGTCTATTGTTTCACATTGGTTTCGATTGTGACTAGATCGAACACTCGCTTGCAACCTGGGTTTG 3 4 5' arm Tribolium_castaneum mirbase mir-279 2e-45 tca-mir-279e 5e-49 -36.5 .....((((((..(((((((((.(((((((.(((((.....((((((((....))).))))).))))).))))))).)))))).))).)))))). (-36.50)