mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CGCAGGATTTGCTTGTGAATGG AATCACAGGAAAATTCTGTGCG TCAAATGGGGTAATTGGCGCCCTGCGCAGGATTTGCTTGTGAATGGGTGTGCTTGATTCAATCACAGGAAAATTCTGTGCGGGGAGTTGGTTTTGTCACCACA 2 0 5' arm Tribolium_castaneum mirbase 100 tca-mir-308 9e-54 -47.4 .....(((((.(((..((.(((((((((((((((.(((((((.(((((.......))))).))))))).))))))))))))))).))..)))...)).))).. (-47.40)