mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CGACTAACTCGATTCAGTTG CTGGGTTGAGTTTGTCTCG CATTTGCCCATCACATCTCGACTAACTCGATTCAGTTGATGTTAATTAGATATCACTGGGTTGAGTTTGTCTCGATGTTTTGTGCCCATC 3 0 5' arm Tribolium_castaneum mirbase 100 tca-mir-309b 4e-46 -34.5 .....((.((..(((((..(((.(((((((((((((.((((((.....))))))))))))))))))).)))..)))))..)).))..... (-34.50)