mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CAGCTGCCTTTTGAAGGGCTAT GGCTCGTCATGGGGTAGCTAGC TTGACAACTGGGTGCCGCAGGGCTCGTCATGGGGTAGCTAGCGTGTGATTAACAGCCAGCTGCCTTTTGAAGGGCTATATGGCATTGGTTTTTTA 6 0 3' arm Tribolium_castaneum mirbase 100 tca-mir-980 5e-49 -41 .....(((..(.(((((...(((((.(((..((((((((.((.(((.....))))).))))))))..))).)))))...))))))..)))..... (-41.00)