mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure GTAGGCCGGCGGAAACTACTTGC AGGGGTTTCTTTCGGCCTCCAG ATCGAGCTTTCGGTGCAGAAGCCGCTATTAACGTGGTGACGCAAGAGTAGGGGTTTCTTTCGGCCTCCAGCGGATAATAAAGAGTTGTAGGCCGGCGGAAACTACTTGCTTTTACGTTGCATTACCTTCGCTGCGGCTTCCCGTCAATGATGCGTTTT 2 1 3' arm Tribolium_castaneum mirbase 100 tca-mir-2796 2e-86 -61.84 .....((..(((.(((.((((((((.......(((((((((.((((((((((((((((.(((((((.((((............)))).))))))).))))))).))))))))).)))..)))))).......))))))))..).)).))).))..... (-61.84)