mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure GATCACATGTGGGTCGTA TGTCTCGCATCTGACGG TTTTGTCCAAGCTCAAGTCCGATCACATGTGGGTCGTATATTTTCAATATTATCATAATATATGTCTCGCATCTGACGGTCTTGGGGTGGGTTGTT 2 1 5' arm Tribolium_castaneum mirbase 100 tca-mir-3805a 1e-49 -35.74 .....((((..((((((.(((.(((.(((((((.((((((((..............)))))))).))))))).)))))).)))))).))))..... (-35.74)