mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure GTCGGTCAGTTGGTTATGAA CATAACTTGCTCGCTGATGT TCATTAATGTTTGGCGGAAATCATAACTTGCTCGCTGATGTAATTTTAACAGACGTCGGTCAGTTGGTTATGAATTCTGATAAATGTTTGCTC 3 0 3' arm Tribolium_castaneum mirbase 100 tca-mir-3809 7e-48 -30.7 .....((((((((.(((((.((((((((.(((.((((((((...........)))))))).))).)))))))).))))).))))))))..... (-30.70)