mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTCTTACTTGCGGTGTACA TACAACCGTGAGTGGAGA ATACGGTTTTAACTAATTCTCAGGATTCTTACTTGCGGTGTACATGTTTTGGTATGAATAGTAAATATGTACAACCGTGAGTGGAGACTGGGGGTTGGTTAGTCAACAGCTT 2 3 5' arm Tribolium_castaneum mirbase 100 tca-mir-3811e 4e-59 -43.7 .....((((((((((((((((((..(((..(((..((((((((((((((..((....))...)))))))))).))))..))))))..)))))))))))))))..)))..... (-43.70)