mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TAGTACGGATTGAACACGTCGC GACTTGTTCTCTCTGTATTGTG TGTAATAAACTCACAAAATGCGACTTGTTCTCTCTGTATTGTGTGGAGTTGCTCATAGTACGGATTGAACACGTCGCTGTTTTTGAGTTTACGCTT 3 0 3' arm Tribolium_castaneum mirbase 100 tca-mir-3889 1e-49 -39.2 .....((((((((.((((((((((.(((((..(((((((((((.(......).)))))))))))..))))).))))).)))))))))))))..... (-39.20)