mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure GGTTTTAATTCCATAATGCA CGGTTTATTGGAATTAATTGT TGAAATTTGCGGTTTTAATTCCATAATGCAGACGATTTTTACGACGGCGGAACGTGAGCGGTTTATTGGAATTAATTGTAAACAAAA 4 5 5' arm Tribolium_castaneum mirbase 100 tca-mir-3894 3e-44 -17.4 .....((((((((..((((((((...(((..(((..(((..(....)..))))))..)))......))))))))))))))))..... (-17.40)