mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure GCGGTTTATTGGAATTAATT TTTTAATTCCATAATGCAG TGAAATTTGCGGTTTTAATTCCATAATGCAGACGATTTTTACGACGGCGGAACGTGAGCGGTTTATTGGAATTAATTGTAAACAAAA 3 5 3' arm Tribolium_castaneum mirbase 100 tca-mir-3894 3e-44 -17.4 .....((((((((..((((((((...(((..(((..(((..(....)..))))))..)))......))))))))))))))))..... (-17.40)