mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TATCACAGCCAGCTTTGATGT GTCAAAGTGGTCAGTGATGTG TTCTCCGACACGTCAAAGTGGTCAGTGATGTGTCGCAAAATGAAATTCATATCACAGCCAGCTTTGATGTGTTGTGCGCTTGTCGACCCAT 1 2 3' arm Brugia_malayi mirbase mir-2 2e-33 cel-mir-2 0.00000007 -31.7 .....(((((((((((((((((..((((((((...(.....).....)))))))).)))).)))))))))))))................. (-31.70)