mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCGGACCAGGCTTCATTCCCT GGACTGTTGTCTGGCTCGATG GAGAAAAATGATTGTTTCTGAGGGGACTGTTGTCTGGCTCGATGCATTAATAATAATTATAATTATATAATTATAATTATCATGAAAAAAGGGTATCGGACCAGGCTTCATTCCCTTCAGAATCAAATTCATTGTT CCCACGCGTCCGCCCACGCCCCCTTCCACGCGTCCGGTCAGCATTCGGCAACCGATGCTGCCCATGTTATCATCGATCTCTGCTTCTCTCTATAAAGCCAAAGTGCCCTAGGGCTTCTTTCTTTTAACCCTCTCCCCATTTAAACAAAAAGAAAAAAAAATATTTGTTTTCGTTTCTGTTCTTTCTTTGATGAGATCTAAATTCTTATATGTTCTCATCTGGGTTAGCTTAGGGTTTTGAGAGCAGGAAGCCATGAAAGTCGATGGATGGGAGAAAAATGATTGTTTCTGAGGGGACTGTTGTCTGGCTCGATGCATTAATAATAATTATAATTATATAATTATAATTATCATGAAAAAAGGGTATCGGACCAGGCTTCATTCCCTTCAGAATCAAATTCATTGTTTGATTTTTTTTGAGAGGTTATGGTTGATGGGAATGTTGTTTGGCTCGAGGGTCATCTAGGTTTTCAAAATTTTCTCGGACTTTCTTTCTTGCTTTTATTTTTCCAGGAAAATTATGTTATTTGCCTATGTGATCTCGGACCAGGCTTCATTCCCGTCAACCGACGGTTTCTCTCTTTCTCAAGCTGCTATTATGATGGTGGTGGTGATGAAGTGACGATACTTTCCCGGGGAAAATAAAAAAATTGTGGTGATTGGTGATTGGTAAAAGTTTTCTCTCTTCTCTCTCTCTCTTCTCTTTAACCTTCCCCTGGTCTTAATAATTTTCTCCAAAAAATTTTCCGGAATTTGGGGATTTGCATGGAATCATTTTGAACCCGTCTTATAAAAAAAAATTTAACAAGAAAGTTTCGGGT 4 0 3' arm Citrus_reticulata mirnest mir-166 0.00003 crt-MIR166b 1e-25 -48.4 ......((((((((.(((((((((((.((..((((((.(((((((....((.((((((((((((....)))))))))))).)).........))))))).))))))..)).))))))))))).)))..)))))... (-48.4)