mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGGCAGTGTGGTTAGCTGGTTGT AACGGCTATCATCACTGCCGTC CCAAATACGGGGATTTACCGGGTGGCAGTGTGGTTAGCTGGTTGTCAGCATATCGGACAACGGCTATCATCACTGCCGTCCTGGTTTTCCTAAAGTTCAGCATCTTCCTGT 0 3 5' arm Brugia_malayi mirbase mir-449 6e-43 tca-mir-34 0.0000003 -44.8 ......((.((((...((((((((((((((((((.(((((.(((((.........)))))))))))))).)))))))).))))))..))))...))............... (-44.80)