mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGATATGTCTGATATTCTTGGGTT CCAGCATCTCAGACGTATCGGC GCACTTCCTGCATATGCAGTGTTGATATGTCTGATATTCTTGGGTTGTGCAAAGTCAACCAGCATCTCAGACGTATCGGCCACTGTGTATT 2 2 5' arm Brugia_malayi mirbase mir-50 1e-37 cbr-mir-50 0.000001 -36.2 (((.....))).((((((((((((((((((((((.((.((..(((((........))))))).)).))))))))))))).))))))))).. (-36.20)