mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure ATAAAGCTAGGTTACCAAAGCT CTTTGGTTATCTAGCTGTATGA GTATTGCAACTTTACTTTGGTTATCTAGCTGTATGAGTAAGTTACTGGCTTCATAAAGCTAGGTTACCAAAGCTAAGCACAATAC 4 0 3' arm Brugia_malayi mirbase mir-9 4e-28 bma-mir-9 4e-43 -31.6 ((((((...(((..(((((((.((((((((.(((((((.((...)).)).))))).)))))))).)))))))..)))..)))))) (-31.60)