mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TATTGCACTCGTCCCGGCCT GTCGAGTCGTTTGCACTATT CATACTGCACTAATCAGTCAGGTCGAGTCGTTTGCACTATTCAGACAGAAGTTCATCATTTGGCGATATTGCACTCGTCCCGGCCTGAGTGTTAGCTGCTATTAT 5 0 3' arm Brugia_malayi mirbase 100 xbo-mir-92a 0.000005 -34.4 ......(((((((.((.((((((((.(.((..((((.((((....((((.(.....).))))..)))).))))..)).).)))))))).)))))).)))...... (-34.40)