mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TAAGGCACGCGGTGAATGCCAA CGCTTTCACCGGTGACCTTGGT CAAAGGACGTCTCGCTTTCACCGGTGACCTTGGTTTGTTATGTTTAGTACTAAGGCACGCGGTGAATGCCAAACGTTCTCTTGCTATACCT 4 2 3' arm Brugia_malayi mirbase mir-124 0.00002 ppc-mir-124 0.000001 -34.4 ((((((((((...((.((((((((((.((((((((((.......))).)))))))))).))))))).))...))))))).)))........ (-34.40)