mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGGAATGTAAAGAAGTATGTA CATACTTCCTTACATGCCCATA AAAGTGACCGTACCGAGCTGCATACTTCCTTACATGCCCATACTATATCATAAATGGATATGGAATGTAAAGAAGTATGTAGAACGGGGTGGTAGT 2 1 3' arm Caenorhabditis_elegans mirbase mir-1 5e-31 crm-mir-1 3e-32 -41.4 ......((((..(((..(((((((((((.((((((..(((((((((.......)))).))))).)))))).)))))))))))..)))..))))... (-41.40)