mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TATCACAGCCAGCTTTGATGTGC CATCAAAGCGGTGGTTGATGTG TAAACAGTATACAGAAAGCCATCAAAGCGGTGGTTGATGTGTTGCAAATTATGACTTTCATATCACAGCCAGCTTTGATGTGCTGCCTGTTGCACTGT 2 3 3' arm Caenorhabditis_elegans mirbase mir-2 1e-34 crm-mir-2 0.000000005 -38.4 ...(((((..((((..(((((((((((((((...(((((((..(((.....)).)...)))))))..))).))))))))).)))..))))...))))) (-38.40)