mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure AGGCAGTGTGGTTAGCTGGTTG ACGGCTACCTTCACTGCCACC CGGACAATGCTCGAGAGGCAGTGTGGTTAGCTGGTTGCATATTTCCTTGACAACGGCTACCTTCACTGCCACCCCGAACATGTCGTCCATCTTTGAA 2 3 5' arm Caenorhabditis_elegans mirbase mir-449 5e-43 crm-mir-34 1e-31 -37 .((((.(((.(((.(.(((((((.(((.(((((.(((((........)).)))))))))))..))))))).)..))).)))...))))......... (-37.00)