mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCACCGGGTGGAAACTAGCAGT TGCTGGTTTCTTCCACAGTGGTA TCTCGGATCAGATCGAGCCATTGCTGGTTTCTTCCACAGTGGTACTTTCCATTAGAACTATCACCGGGTGGAAACTAGCAGTGGCTCGATCTTTTCC 2 1 3' arm Caenorhabditis_elegans mirbase mir-36 6e-49 100 -54.3 ....(((..(((((((((((((((((((((((.((.(.((((((.(((......))).)))))).))).)))))))))))))))))))))))..))) (-54.30)