mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCACCGGGTGAACACTTGCAGT TGTGGGTGTCCGTTGCGGTGCTA TTCTAGAAACCCTTGGACCAGTGTGGGTGTCCGTTGCGGTGCTACATTCTCTAATCTGTATCACCGGGTGAACACTTGCAGTGGTCCTCGTGGTTTCT 8 1 3' arm Caenorhabditis_elegans mirbase mir-36 1e-49 100 -44.7 ....((((((((..((((((.((..(((((....(.(((((.((((..........)))).))))).)...)))))..)).))))))..).))))))) (-44.70)