mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCACCGGGTGTAAATCAGCTTG AGCTGATTTCGTCTTGGTAATA TATACCGAGAGCCCAGCTGATTTCGTCTTGGTAATAAGCTCGTCATTGAGATTATCACCGGGTGTAAATCAGCTTGGCTCTGGTGTC 2 2 3' arm Caenorhabditis_elegans mirbase mir-36 5e-43 crm-mir-40 0.001 -43.3 .(((((.((((((.(((((((((((.((((((.((((.((((....)))).)))).)))))))).))))))))).))))))))))). (-43.30)