mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CTGGATGTGCTCGTTGGTCATA TGACTAGAGACACATTCAGCT GAGAAAATGGCCAATCTGGATGTGCTCGTTGGTCATAGACGTCAACACGAACTGTTCATATGACTAGAGACACATTCAGCTTGGCCTGCTTCTCTA 0 3 5' arm Caenorhabditis_elegans mirbase mir-44 1e-46 cel-mir-44 1e-49 -42.1 (((((...((((((.((((((((((((..(((((((((((.((.....))...)))..))))))))))).))))))))).))))))...))))).. (-42.10)