mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGTCATGGAGTCGCTCTCTTCA AAGAGAGCCGTCTATTGACAGT CTGAGGTGAAGCTGAAGAGAGCCGTCTATTGACAGTTCAAGACCACGAGTCGTTGTGTGCTGTCATGGAGTCGCTCTCTTCAGATGATCCGGTCAAT 2 2 3' arm Caenorhabditis_elegans mirbase mir-46 1e-37 cbr-mir-46 0.000000000001 -39 ....((.....(((((((((((..(((((.((((((.((((((.....))).)))...)))))))))))...))))))))))).....))....... (-39.00)