mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CACCCGTACATATGTTTCCGTGCT CACGTTACAATGAAAGGGTAGC TCCAACTCTAACAGTCCACCCGTACATATGTTTCCGTGCTTGACAGCGAAGCTCAATCACGTTACAATGAAAGGGTAGCCGGTTATTGAAGTTGGGTCTT 7 2 5' arm Caenorhabditis_elegans mirbase mir-52 9e-51 cbr-mir-52 9e-20 -25.7 ((((((((((((.(.(.((((...(((.(((...((((.(((((......).)))).))))..))))))...)))).).).))))..).))))))).... (-25.70)