mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TATGACACTGAAGCGAGTTGGAAA TCTAACTCGTCGGTAGTCATCGT TCAACAAGCAGACACAATTTCTAACTCGTCGGTAGTCATCGTTCTAGCTGAAAAGGACACTATGACACTGAAGCGAGTTGGAAATAGTGGTTCTACTTGAGCAA 1 3 3' arm Caenorhabditis_elegans mirbase 100 crm-mir-63 0.000001 -38 ....((((.((((((.(((((((((((((((((.(((((.(((((........)))))...)))))))))..))))))))))))).)))..))).))))..... (-38.00)