mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TATGACACTGAAGCGTTACCGAA CGGTGCAACGATCAGTGGCATGCT CTCCCCGCTGACCTCGCCGAATATGACACTGAAGCGTTACCGAACCGTTTTCCCACACCTGGATTCGGTGCAACGATCAGTGGCATGCTCGGCTAGCGCCAGTTAAGTAT 2 3 5' arm Caenorhabditis_elegans mirbase mir-64 1e-56 cel-mir-65 0.000001 -38.5 ......((((.(((.(((((.((((.((((((..(((((((((((((............))).)))))))..))).)))))).)))).))))).)).).))))....... (-38.50)