mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTGCTTGCAACGCTTGACCAC GATCAAACGTTGTAAATAAAA TACTACTCATTCCGTCTCACAATATAAGAGATTTTCAGTTTTTGCTTGCAACGCTTGACCACTCGTCTTATTCAATTGTTTTTTACAAATATAGAAAACGAAAAGTTATGTTTAATATACTCTAGGGTATAAAGTAAGTCACAAATAAAATAAATAATAATTTTAAAAAATTTTGAATAAAACGAGTGATCAAACGTTGTAAATAAAAACTTAAAATCTCTCATATTATTGGACGAAGGGAGTACA ACTCGCCAAGCCTCTCGCAACCTTAGCTACAGTCCTACAGAAACAAAAGGAGAGCGCGATCAAGAAACGGGCGTTGCGCGACATCGGCGCGGGTCGGCGCAGATGGGCAACTGCCAGGCGGCGGAGGTGGCGACGGTAGTCATCCAGCACCCGGGCGGCGGCCGCACGGAGCGCGCGTACTGGGCGATGTCCGCGGGCGCCGTCATGGCGGCCAACCCGGGACACTACGTCGCCGCCGTGATCACCTCGCCTCCCGCCGCCGGCGCCTCCTCGGCCACCGGCGCCGCCGCGCCCGTCAAGCACCTCAAGCTGCTCCGCCCCGACGACACGCTCCTGCTCGGCCGTGTCTACCGCCTCGTCAGCTTCGAAGAGGTGCTGAGAGAGTTCGCGTCGAAGCGGCATGTCAAGCTAAGCCGTGCCACGATCAAGGCCAAGGATGACGTGGAGGAGGAGACGAAGCCCGCCAAGCCTCGCCGCCGGCGAGGCAACGGCGGCATCGCGCCAGAGGAGGAGTACTCCAGCCGGTCACTCGCAAAGGTAGTACGTCCAAGCCCAATGCATTCTCCCTGTTACGGAATTTCATTTGCCGTTTGCTTGTACGTGCACCGTATCATGATATCATATCCCAACTGCTGGCTCCCAGAATCCCCTGTGATCTGACCCGTCGCCATCGGTGGATCAAATCTGAAGCCCTGATGAATCACGCGCAAATCGCCATTACTATTTCCAAACTATACTACTCATTCCGTCTCACAATATAAGAGATTTTCAGTTTTTGCTTGCAACGCTTGACCACTCGTCTTATTCAATTGTTTTTTACAAATATAGAAAACGAAAAGTTATGTTTAATATACTCTAGGGTATAAAGTAAGTCACAAATAAAATAAATAATAATTTTAAAAAATTTTGAATAAAACGAGTGATCAAACGTTGTAAATAAAAACTTAAAATCTCTCATATTATTGGACGAAGGGAGTACACTATACAGAACTATGCTACCTTCAACTGTCGACATGGCCATGGCAACAACTCTTCATGTCCTCGTGAATATCCAGTAAATCCACTCACTCTCAAGATTCCATCTGTCCAGGTCATGCGCCAGAGTGACGAGCCGGAGCCCGTGGCGAGGGCGAGCCCGTCCGCCGCGCCGAAGCCGGAGAGCGACATTGATGACCACGCCGACGGCGAGGCGGCCGAGCCGGACTGCGACCTGGAGGCGCTGCTGCCGCCGCACGGGGTGGTGTTCGGCCGGCGAGTCGCCCGGCAATGGAGACCGGCGCTGCAGAGCATCGCGGAAGGGTGAGGCCGACCCACTGGCTCAGGCTGGCCGACGGCGAGCCGGCTGCAAGACTTCGTCGTCGACTCGTCGTTTCCGAGCACACAGCGTAGTACTGCAGTTGTAGAAAGTGAAGTAGTGACAAGTCTCACTGGACGTGTAGCGTGACAAGTCATGTAGAATAAAGCTACGAGTACCTTGTGGATATATCCAGCTGATGCATGTACGTATACTATGGATTGATGATGGGTGTAACGTGACGGATCGTATACTCCAATAAGTTTGCCAAAAAAAAAAAAAACCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA 3 0 5' arm Oryza_sativa mirnest MIR812 4e-46 osa-MIR818e 0.00000000000006 -71.9 ...(((((.((.(((((...(((((.(((((((((.((((((((.((((((((.((((.(((((((.((((((((..((((((((.((.(((.............((.((((((.((((((....))))))...)))).)).))............))).)).)))))))).)))))))).))))))).)))).)))))))).)))))))).))))))))).)))))...))))).)).))))).. (-71.9)