mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTCATCAGGCCATAGCTGTCCA GATGGTTGTGCTCTGAGGAAAT GCATCTGCCAAACCGCCCGTTTGGATGGTTGTGCTCTGAGGAAATACGCACAGAATGTCATTTCATCAGGCCATAGCTGTCCAAATTGGTATAGAGTTTG 3 0 3' arm Caenorhabditis_elegans mirbase mir-77 9e-51 cel-mir-77 5e-52 -35.4 ........(((((((((.(((((((((((((((..((((.(((((..(((.....))).))))).))))..))))))))))))))).)))...).))))) (-35.40)