mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure ATAAAGCTAGGTTACCAAAGCT CTTTGGTGATTCAGCTTCAATGA TAGTAGACATTCTCCGATCTTTGGTGATTCAGCTTCAATGATTGGCTACAGGTTTCTTTCATAAAGCTAGGTTACCAAAGCTCGGCGTCTTGATCTAC 4 1 3' arm Caenorhabditis_elegans mirbase mir-9 2e-30 cbr-mir-79 2e-17 -36 ..(((((((..(.((((.((((((((((..(((((..((((..(((.....)))....)))).)))))..)))))))))).)))).)...)).))))) (-36.00)