mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CTGGGCTCAGATTCGCTTAGGC CTAAGTGAATGCTTTGCCACAGTC CGTGTCCACGCCGTCTAAGTGAATGCTTTGCCACAGTCTTCGATGTTCTGAAATGAAGCCTGGGCTCAGATTCGCTTAGGCCGGAGTTTGACACGGCA 3 2 3' arm Caenorhabditis_elegans mirbase mir-86 9e-48 cel-mir-86 8e-51 -42.6 ((((((.((.((((((((((((((.((..(((.(((.(((((.(.......).))))).))))))..))))))))))))).))).))..))))))... (-42.60)