mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGATATGTTGTTTGAATGCCCCT CGGCTTTCAACGACGATATCAAC GGGCGCCATTTCGAGCGGCTTTCAACGACGATATCAACCGACAACTCACACTTTTGCGTGTTGATATGTTGTTTGAATGCCCCTTGAATTGGATGCCA 2 2 3' arm Caenorhabditis_elegans mirbase mir-90 1e-49 crm-mir-90 0.000000001 -43.2 .(((((((.((((((.(((.(((((((((.((((((((((.(((.........))))).)))))))))))).))))).))).)))))).))).)))). (-43.20)