mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TAAGGCACGCGGTGAATGCCA GCATGCACCCTAGTGACTTTAGT GTCCCACTTGTCATCTGGCATGCACCCTAGTGACTTTAGTGGACATCTAAGTCTTCCAACTAAGGCACGCGGTGAATGCCACGTGGCCATGATGGG 3 2 3' arm Caenorhabditis_elegans mirbase mir-124 5e-43 crm-mir-124 3e-19 -40 ..(((((..(((((.((((((.((((...(((.(((((((((((......))))....))))))))))..)))).)))))).)))))...).)))) (-40.00)