mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure AATGGCACTGCATGAATTCACGG GCGGATCATACGGTACCATAGC CCTTATCCCGTTCGCAATGGCACTGCATGAATTCACGGCTATGCATAACGACAGACCGCGGATCATACGGTACCATAGCGGACGGTGATGAGGTTAAT 4 1 5' arm Caenorhabditis_elegans mirbase mir-228 1e-49 crm-mir-228 2e-23 -44.2 (((((((((((((((.((((.((((.((((.(((.(((((...(.....)..)).))).))))))).)))).)))).)))))))).)))))))..... (-44.20)