mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure GTATTAGTTGTGCGACCAGGAGA ACTTGGTCGGCGATTTAATATTA TTGATGTAATGCCGTCACTTGGTCGGCGATTTAATATTATCAGAACATAGGAAATTGTTAGTATTAGTTGTGCGACCAGGAGACGGTATTCGCATATT 1 2 3' arm Caenorhabditis_elegans mirbase mir-230 1e-49 crm-mir-230 0.00000000002 -37.9 ...(((((((((((((.((((((((((((((.(((((((.(((...........))).))))))))))))).)))))))).))))))))).))))... (-37.90)