mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TAAGCTCGTGATCAACAGGCAGAA CTGACTGTTTCAAAAGCTTGTA TAGCACCACAGGTTGTTCTGACTGTTTCAAAAGCTTGTAGTATCTTAATAAATAAACATATAAGCTCGTGATCAACAGGCAGAACAACTCGGTTTTGTG 3 2 3' arm Caenorhabditis_elegans mirbase mir-231 1e-40 crm-mir-231 0.0000003 -32.6 ..(((..((.((((((((((.((((((((..((((((((.(((........)))....))))))))..)))..))))).))))))))))..))..))). (-32.60)