mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TAAATGCATCTTAACTGCGGTGA CCTGCAGTTTCGATGATTTTATC AAGTTCAATTTTTGGATCCCTGCAGTTTCGATGATTTTATCCTTAATTCTGAAGATGTGATAAATGCATCTTAACTGCGGTGATCTAGATCATGAACA 5 0 3' arm Caenorhabditis_elegans mirbase mir-232 1e-49 cel-mir-232 8e-51 -35.6 ..(((((...((((((((.((((((((..((((..(((((((.....((....)).).))))))..))))..)))))))).))))))))...))))). (-35.60)